接到環(huán)境保護部副部長潘岳的有關信訪批示后，環(huán)境保護部環(huán)境監(jiān)察局立即責成江西省環(huán)保廳調查處理。
樟樹鹽化工基地共有污水處理廠1家、化工企業(yè)20家。江西省環(huán)保廳分管副廳長帶隊，赴現(xiàn)場展開全面調查，發(fā)現(xiàn)基地存在以下環(huán)境問題：一是基地污水處理廠和江西藍恒達化工有限公司等7家企業(yè)存在超標排放、偷排問題;二是江西宏宇能源發(fā)展有限公司等16家企業(yè)污染防治設施不完善;三是環(huán)境基礎設施不健全、雨污分流不徹底、危險廢物管理不規(guī)范。
針對發(fā)現(xiàn)的問題，江西省環(huán)保廳向樟樹市政府、宜春市環(huán)保局下發(fā)了整改通知。2015年11月17日，江西省環(huán)保廳派工作組駐點督促、指導抓好整改工作，并約談了樟樹市委、市政府主要負責人，要求樟樹市政府按要求抓好整改工作;對基地環(huán)境問題實行掛牌督辦;暫停省、市、縣三級對基地建設項目環(huán)評審批，直至整改到位;對基地環(huán)境違法違規(guī)企業(yè)立案查處，涉嫌犯罪的移送司法機關處理。
2015年12月23日，江西省環(huán)保廳對基地污水處理廠超標排放廢水違法問題擬罰款35.0595萬元，對逃避監(jiān)管排污處10萬元罰款，責令改正違法行為，限期拆除偷排設施(已拆除)。宜春市環(huán)保局和樟樹市環(huán)保局責令江西藍恒達化工有限公司等5家超標企業(yè)立即停止違法行為。
樟樹市政府對存在環(huán)境問題的16家涉水企業(yè)全部停產整改。樟樹市環(huán)保局將涉嫌偷排廢水的環(huán)境違法案件移交司法機關處理。樟樹市公安機關已對兩家企業(yè)的4名涉嫌環(huán)境犯罪人員采取刑事強制措施。
宜春市紀委監(jiān)察局派出調查組，對樟樹市有關部門和人員履職情況進行調查。樟樹市委、市政府成立整治工作領導小組，督促落實整治工作。樟樹市環(huán)保局安排專人進駐重點企業(yè)。
除鹽化工基地外，樟樹市政府組織對全市其他所有工業(yè)企業(yè)環(huán)境問題開展全面排查，重點檢查有廢水外排企業(yè)。
